黑龙江省农业科学院牡丹江分院成立于1958年，是黑龙江省东南部集研究、开发、推广于一体的综合性农业科研单位，现有在职职工93人，其中具有正高级职称13人，副高级职称26人，中级职称的34人。具有博士学位3人、在读博士研究生5人，硕士58人。占地面积148公顷，其中试验地面积100公顷。

   黑龙江省农业科学院牡丹江分院设有行政办公室、党务办公室、科研科、财务科四个职能部门和水稻研究所、果树研究所、食用菌研究所、蜜蜂研究所、经济作物研究所、玉米研究所、大豆研究所、土壤生化研究所八个研究单位。

   黑龙江省农业科学院牡丹江分院的职责任务是：承担我省东南部山地丘陵区农业可持续发展研究；承担本区农作物和食用菌等种质资源收集、鉴定、创新和品种选育研究；承担耕作栽培、施肥技术、耕地质量提升技术等研究；承担作物病虫草害测报防控技术、蜜蜂繁育技术等研究；承担果品、食用菌、蜂产品、中药材加工技术研究；承担农业基础性长期性科研数据观测监测任务。

   经过60年的发展建设，分院已发展成为黑龙江省东南部专业齐全、设施完备、人才济济、对外开放的综合性农业科研单位。“八五”以来，承担国家省市各类科研项目共310项，其中国家“973”项目1项，国家“863”项目4项，国家成果转化资金及自然基金等项目12项，与美国、俄罗斯、日本、朝鲜、韩国等十多个国家的大专院校保持科技合作与交流，承担国际合作专项12项。1978年以来，获各级成果奖励215项，“水稻育苗壮秧剂研制与推广应用”获得“省长特别奖”，《中国蜜粉源植物》获第33届国际蜜蜂大会金奖，“抗寒优质耐贮李新品种牡丰李选育与推广”、“食用菌优良品种选育及标准化栽培技术研究与应用”等9个成果获得省科技进步二等奖。1982年（六五）以来，共审定各类作物品种99个，其中水稻品种—牡丹江19、牡丹江28、牡丹江35，玉米品种—牡单9、牡单10、牡单13，大豆品种—牡豆8、牡豆9 、牡豆10，果树品种—龙冠苹果、龙丰苹果、金香水梨、矮甜李、牡红杏、丹江黑黑穗醋栗，食用菌品种—牡耳1号黑木耳，晒烟品种—龙烟6号、龙烟7号等品种在生产中广泛应用。作物新品种、自主研制的各种农化产品在全省和全国适宜区域累计推广面积达5.5亿多亩，科研成果累计创社会效益300多亿元，对农业增效、农民增收、起到了巨大推动作用。