黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院科研条件优越。承担国家现代农业产业技术体系综合试验站2个，分别为国家水禽产业技术体系齐齐哈尔综合实验站和国家肉牛牦牛产业技术体系齐齐哈尔综合实验站。国家基础性长期性观测站2个，分别为国家农业基础科研畜禽养殖数据中心齐齐哈尔站、国家动物疫病数据中心黑龙江省观测监测站。是国家草品种测试齐齐哈尔站、国家草品种区域试验齐齐哈尔试验站和国家青贮玉米品种测试站的依托单位。拥有黑龙江省工程技术研究中心3个，分别为黑龙江省牧草育种与种质资源利用工程技术研究中心、黑龙江省饲用中草药发酵工程技术研究中心和黑龙江省青贮玉米育种与栽培调制技术创新中心。黑龙江省中国科学院科学家工作室3个，分别为黑龙江省中国科学院黄瑞林生猪营养调控科学家工作室、黑龙江省中国科学院王敏青贮玉米育种与栽培调制工作室和黑龙江省中国科学院刘俊杰草田轮作工作室。黑龙江省中国科学院科学家工作室3个。黑龙江省重点实验室3个，分别为黑龙江省草原与牧草育种重点实验室、黑龙江省动物胚胎工程重点实验室和黑龙江省兽用药物重点实验室。配套齐全的实验室及氨基酸分析仪、荧光定量PCR仪、近红外饲料分析仪、原子吸收分光光度计、气象色谱仪、离子色谱仪等精密仪器300台套。  

  分院富拉尔基科研基地占地面积5658亩，其中耕地2155亩，草原1424亩，水面620亩，基地大楼办公区占地75000平方米，建筑面积5829平方米；富裕科研基地占地面积38000平方米；龙沙区科研主体楼房4200平方米；昂昂溪区黄沙岗第二科研基地10万多平米，具备与研究室专业方向配套的试验条件。