黑龙江省农科院作物育种研究所始建于1956年，是专门从事农作物品种选育与配套栽培技术研究、种质资源收集、保存、鉴定、利用和优良品种推广的综合性研发单位。下设我所现为国家小麦改良分中心（哈尔滨）、农业部植物新品种测试分中心（哈尔滨）、农业部东北地区春小麦科学观测试验站，黑龙江省麦类作物品种改良重点实验室和黑龙江省杂粮作物遗传改良重点实验室。同时还拥有现代农业产业技术体系小麦、高粱、食用豆三个岗位和谷子、大麦两个实验站。

     我所拥有快速黏度仪、梯度PCR仪、基因枪、色度仪、面筋测定系统、记录式和面仪等各种仪器设备1000多台套。为科研工作建立良好的发展平台。随着国家小麦品质改良分中心建设、黑龙江省杂粮作物遗传改良重点实验室和农业部植物新品种测试（哈尔滨）分中心建设和一些大项目的引进，我所又加大了投资力度，相继投资300多万元建成了品质分析实验室、生物技术实验室、植物分子检测实验室、植物病理实验室和植物形态检测实验室，新建种子库1200m²、风干室300 m²、种子晾晒场5000 m²、科技成果展销大厅700 m²。

2015年农业部东北地区春小麦科学观测站实验站建设项目启动，高粱、谷子、食用豆、大麦等作物也急需建采光板棚和抗旱棚等进行抗旱、抗病等各方面的实验研究。经向院里打报告申请，同意在民主园区划出2晌地作为育种所棚室建设区。目前，高粱抗旱棚已经从原来的地址挪移完毕，其他棚室建设主体结构已基本完成，明年就能投入使用。

经过60多年的不断积累，目前我所共有仪器设备等固定资产近1000万元，在全国农业科研单位的综合实力评估中处于前列，为科学研究工作的开展奠定了物质基础。